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Nous avons récemment rapporté que le nucléotide pyrène est préférentiellement inséré en face d'un site abasique, le 3'-T d'un dimère de thymine, et la plupart des bases intactes par l'ADN polymérase eta de levure (pol eta).Parce que le pyrène est une molécule non polaire sans capacité de liaison H, les efficacités inhabituellement élevées de l'insertion de dPMP sont attribuées à sa capacité supérieure d'empilement de bases et soulignent l'importance de l'empilement de bases dans la sélection des nucléotides par pol eta.Pour étudier le rôle de la liaison H et de la géométrie des paires de bases dans la sélection des nucléotides par pol eta, nous avons déterminé les efficacités d'insertion des nucléotides à base modifiée 2,6-diaminopurine, 2-aminopurine, 6-chloropurine et inosine qui créer un nombre différent de liaisons H avec la base du modèle en fonction de la géométrie de la paire de bases.L'appariement de bases Watson-Crick semble jouer un rôle important dans la sélection des analogues de nucléotides pour l'insertion en face de C et T, comme en témoigne la diminution des efficacités relatives d'insertion avec une diminution du nombre de liaisons H Watson-Crick et une augmentation de le nombre d'interactions donneur-donneur et accepteur-accepteur.La sélectivité de l'insertion de nucléotides est plus grande vis-à-vis du 5'-T que du 3'-T du dimère de thymine, en accord avec des travaux antérieurs suggérant que le 5'-T est maintenu plus rigidement que le 3'-T.De plus, l'insertion de A en face des deux T du dimère semble être médiée par l'appariement de bases de Watson-Crick et non par l'appariement de bases de Hoogsteen basé sur les efficacités d'insertion presque identiques de A et de 7-deaza-A, ce dernier étant dépourvu de H- capacité de liaison à N7.Les efficacités relatives pour l'insertion de nucléotides qui peuvent former des paires de bases Watson-Crick sont parallèles à celles du fragment de Klenow, tandis que le fragment de Klenow discrimine plus fortement les mésappariements, en accord avec sa plus grande sélectivité de forme.Ces résultats soulignent l'importance de la liaison H et de la géométrie des paires de bases de Watson-Crick dans la sélection des nucléotides par la pol eta et le fragment de Klen ow, et le moindre rôle de la sélection de forme dans l'insertion par la pol eta en raison de sa forme plus ouverte et moins site actif contraint.